SMAD geenit, SMURF geenit , SARA, SNIP, ZEB kromosomistossa

Koska  SMAD proteiinien järjestelmää on ihmisen joka solussa,  niillä täytyy olla  melko hyvin edustettu  tausta genomissa. Miten ne asettuvat  geenistöömme?
 Sitä mukaa kun geenejä on sekvensoitu, löytyy tietoa internetistä:

Katsoin lähteestä  UniGene miten niiden geenit  asettuvat.  (PubMed tietä haettuna)
Tarkistan  https://www.genenames.org/cgi-bin/genefamilies/set/750

SMAD1 asettuu neloskromosomiin  4q31.12  asemaan.( Se on BMP reseptorin R- SMAD)
MADH1, JV41.

SMAD 2 asettuu 18,  kromosomiin,  18q21.1 asemaan. (Se on TGFbeta R- SMAD)
MADH2m MADR2, JV181.

SMAD3 asettuu 15. kromosomiin: 15q22.33 asemaan. ( Se on TGFbeta R- SMAD).
MADH3, JV15-2, HST17436.

SMAD4 asettuu 18. kromosomiin: 18q21.1 asemaan.  (  Co-SMAD, Common Partner SMAD)
MADH4, DPC4.

SMAD5 asettuu  vitoskromosomiin: 5q31.1.
MADH5, Dwfc, JVS-1.   ( Se on BMP R-SMAD)

SMAD6 asettuu  15. kromosomiin: 18q21. ( Tämä on I-SMAD, inhibitorinen SMAD).
MADH7, MADH6.

SMAD7 asettuu 18. kromosomiin: 18q21.1 ( Tämä on I-SMAD, inhibitorinen SMAD).

SMAD8, SMAD8/9, SMAD9  asettuu  kromosomiin 13q13.3.
MADH6,MADH9.

Sitten on tässä SMAD- järjestelmän yhteydessä  sekvensoitu muitakin  geenejä, kuten

SARA ( SMAD Anchor for Receptor Activation isoform) Zinc Finger FYVE domain  containing ), ZFYVEF9, joka asettuu 1- kromosomiin: 1p32.3, (Tästä  koodautuu proteiini joka tarkentaa  SMAD  proteiinin asettumista kohdalleen.

ZEB2 ( SMAD interacting) sijoittuu ainakin  kakkoskromosomiin : 2q22.3.

Lisäksi  mainitaan SNIP ( SMAD Nuclear  Interacting protein 1) joka sijoittuu myös 1- kromosomiin: 1p34.3.

Tärkeitä  SMAD proteiinien silppuroinnissa on  SMURF- proteiinit.
SMURF1 ( SMAD Specific 63 Ubiquitin protein ligase 1)  joka sijoittuu 7. kromosomiin:7q22.1

SMURF2 ( SMAD Specific  63 Ubiquitin protein ligase 2) , joka sijoittuu 17. kromosomiin: 17q22-23.

Smad-proteiinien kuljetukseen tumaan osallistuu  neljä proteiinia:

Gdf5, Growth differentiation factor, kromosomista2.
Sptbn1, Spectrin beta non-erythrocytic 1, kromosomista  11.
Tob1, Transducer of ErdB-2.1. kromosomista  11.
2fyve9, Zinc finfger, Fyve domain containig, kromosomsita 4.


Päivitys 29.9. 2014
Päivitys 15.3. 2018