Etiketter

Visar inlägg med etikett EBOV GP. Visa alla inlägg
Visar inlägg med etikett EBOV GP. Visa alla inlägg

onsdag 19 november 2014

ADAM-17 , TACE, (tumor necrosis factor-α-converting enzyme). Ebolaviruksen tarvitsema isänsätoluproteiini.

ADAM17

From Wikipedia, the free encyclopedia
ADAM metallopeptidase domain 17
Protein ADAM17 PDB 1bkc.png
PDB rendering based on 1bkc.
Available structures
PDB Ortholog search: PDBe, RCSB
Identifiers
Symbols ADAM17 ; ADAM18; CD156B; CSVP; NISBD; TACE
External IDs OMIM603639 MGI1096335 HomoloGene2395 ChEMBL: 3706 GeneCards: ADAM17 Gene
EC number 3.4.24.8611







Species Human Mouse
Entrez 6868 11491
Ensembl ENSG00000151694 ENSMUSG00000052593
UniProt P78536 Q9Z0F8
RefSeq (mRNA) NM_003183 NM_001277266
RefSeq (protein) NP_003174 NP_001264195
Location (UCSC) Chr 2:
9.63 – 9.7 Mb
Chr 12:
21.32 – 21.37 Mb

PubMed search [1] [2]
 ADAM metallopeptidaasidomaani 17 on toiselta nimeltä TACE, tuumorinekroosifaktori-alfaa konvertoiva  entsyymi. Sen koko on 70 kDa ja se kuuluu ADAM-proteiineihin,    disintegrriinien ja metalloproteaasien perheesen.

ADAM metallopeptidase domain 17 (ADAM17), also called TACE (tumor necrosis factor-α-converting enzyme), is a 70-kDa enzyme that belongs to the ADAM protein family of disintegrins and metalloproteases.

 Rakenteeltaan ADAM-17 on 824 aminohapon polypeptidi.

ADAM17 is an 824-amino acid polypeptide.[1][2]

ADAM-17 funktio

  •  On käsitetty siten, että ADAM-17 osallistuu prosessoimaan esim. tuumorinekroosifaktori alfaa solun pinnassa ja  trans-Golgin laitteen intrasellulaarikalvojen sisältä.  Tämä prosessi tunnetaan myös hilseilynä, shedding kalvoon sijoittuneen pro-proteiinin ( kuten pro-TNF-alfa)  liukoisen (soluble)  ektodomeenin pilkkoamisena  ja vapauttamisena. (irrottamisena). ja  tällä tapahtumalla on fysiologista merkittävyyttä.
ADAM17 is understood to be involved in the processing of tumor necrosis factor alpha (TNF-α) at the surface of the cell, and from within the intracellular membranes of the trans-Golgi network. This process, which is also known as 'shedding', involves the cleavage and release of a soluble ectodomain from membrane-bound pro-proteins (such as pro-TNF-α), and is of known physiological importance.
  •  ADAM-17  oli ensimmänen tällainen sheddaasi entsyymi, mikä pystyttiin identifioimaan ja  on käsitetty,että se omaa roolia  monen erilaisen  tekijän irrottamisessa kalvoankkurista: sytokiinien,  soluadheesiomolekyylien, reseptoreitten, ligandien ja entsyymien. irrottamisessa ja vapauttamisessa. 
 ADAM17 was the first 'sheddase' to be identified, and is also understood to play a role in the release of a diverse variety of membrane-anchored cytokines, cell adhesion molecules, receptors, ligands, and enzymes.
  •  Kun kloonattiin TNF-alfa-geeniä huomattiin, että se koodaa 26- kilodaltonin II-tyypin TM-polypeptidiä, joka kiinnittyy solukalvoon kypsyessään. Solukalvossa ollessaan pro-TNF-alfa on biologisesti  aktiivi. ja pystyy aiheuttamaan immuunivastetta juxtakriinisen  signaloinnin kautta. Mutta  pro-TNF-alfa voi käydä läpi myös proteolyyttisen hajoittamisen A76- V77 amidisidoksessaan ( alaniini, valiini) ja pilkkoutumisesta  vapautuu pro-TNF-alfamolekyylistä  liukoista extrasellulaarista  domaania (ektodomaania),  17kDa(soluble).Täm liukoinen fragmentti on sytokiini TNF-alfa ja olennainen  sytokiini- parakriinisessa signaloinnissa. Tätä liukoisen TNF-alfan vapautumista katalysoi ADAM-17.
Cloning of the TNF-α gene revealed it to encode a 26 kDa type II transmembrane pro-polypeptide that becomes inserted into the cell membrane during its maturation. At the cell surface, pro-TNF-α is biologically active, and is able to induce immune responses via juxtacrine intercellular signaling. However, pro-TNF-α can undergo a proteolytic cleavage at its Ala76-Val77 amide bond, which releases a soluble 17kDa extracellular domain (ectodomain) from the pro-TNF-α molecule. This soluble ectodomain is the cytokine commonly known as TNF-α, which is of pivotal importance in paracrine signaling. This proteolytic liberation of soluble TNF-α is catalyzed by ADAM17.

(HUOM:  Ilmeinen analogia  liukoisen  EBOV sGP:n kanssa. Täytyy tarkistaa). 
  • ADAM-17 omaa myös osuutta L-selektiinin, solun adheesiomolekyylin hilseilyssä.Tuoreet tutkimukset viittaavat siihen, että ADAM17 voi omata osuutta myös Notch-signalointitiessä, jossa  vapautuu proteolyyttissti  Notchin intrasellulaarista domaania. Notch 1 reseptorista), mikä tapahtuu ligandin sitoutumisen jälkeen. 
ADAM17 also has a role in the shedding of L-selectin, a cellular adhesion molecule.[3]
Recent in vitro experiments have provided evidence that suggests that ADAM17 may play a prominent role in the Notch signaling pathway, during the proteolytic release of the Notch intracellular domain (from the Notch1 receptor)  that occurs following ligand binding.
  • ADAM-17 säätelee myös MAP-kinaasi-signalointitietä  säätelemällä EGFR-ligandia amfireguliinia  rintarauhassolussa. 
ADAM17 also regulates the MAP kinase signaling pathway by regulating shedding of the EGFR ligand amphiregulin in the mammary gland.[4]

Vuorovaikutuksia. Interactions  Seuraavat vurovaikutukset on havaittu.

ADAM17 has been shown to interact with:
DLG1[5]
MAD2L1,[6][7]
MAPK1.[8]

Sijoittautuminen solussa. Cellular localization

  •  ADAM17 entsyymin sijoittautumisella solussa  arvellaan olevan  tärkeä  määräävä asema  hilseilyaktiivisuudessa.  Klassisesti käsitetään  TNF-alfan prosessoituvan  trans-Golgin laitteessa ja tähän liittyy läheisesti liukoisen TNF-alfa muodon  kuljetus solupintaan.
  • Kuitenkin tutkimukset osoittavat, että suurin osa kypsää, endogeeniä ADAM-.17 entsyymiä paikallistunee  perinukleaariseen aitioon ja vain pieni osa TACE:a  on havaittavissa solun pinnalla. Kypsän ADAM17  entsyymin sijoittuminen perinukleaariseen aitioon sen takia  tuo esiin mahdollisuuden , että ADAM-17 välitteiset ektodomaanin  vapauttamiset, hiljseilyt,  sattaisivat myös alkaa jo intrasellulaarisessa miljöössä- mikä olisi vasten konventionellia ajattelua 
  • .(Mutta sopisi EBOV viruksen GP prosessointiin kyllä hyvin- Kommenttini.)
The localization of ADAM17 is speculated to be an important determinant of shedding activity.
 TNF-α processing has classically been understood to occur in the trans-Golgi network, and be closely connected to transport of soluble TNF-α to the cell surface. However, research that suggests that the majority of mature, endogenous ADAM17 may be localized to a perinuclear compartment, with only a small amount of TACE being present on the cell surface. The localization of mature ADAM17 to a perinuclear compartment, therefore, raises the possibility that ADAM17-mediated ectodomain shedding may also occur in the intracellular environment, in contrast with the conventional model.
  •  Funktionaalista ADAM17 entsyymiä on dokumentoitu yleisesti ilmenevänä ihmisen paksusuolessa. ja sen expressio on kohonnut ulseratiivisessa koliitissa, joka on tulehduksellinen suolistotauti. Jotkut kokeet viittaisivat myös siihen että etanoli saattaisi estää ADAM17 ilmenemistä.
Functional ADAM17 has been documented to be ubiquitously expressed in the human colon, with increased activity in the colonic mucosa of patients with ulcerative colitis, a main form of inflammatory bowel disease. Other experiments have also suggested that expression of ADAM17 may be inhibited by ethanol.[9]

Malliorganismit: poistogeeniset  koe-eläimet

Model organisms have been used in the study of ADAM17 function. A conditional knockout mouse line, called Adam17tm1a(EUCOMM)Wtsi[15][16] was generated as part of the International Knockout Mouse Consortium program — a high-throughput mutagenesis project to generate and distribute animal models of disease to interested scientists.[17][18][19]
Male and female animals underwent a standardized phenotypic screen to determine the effects of deletion.[13][20] Twenty eight tests were carried out on mutant mice and two significant abnormalities were observed.[13] Few homozygous mutant embryos were identified during gestation. The remaining tests were carried out on heterozygous mutant adult mice; an increased bone mineral content was observed in these animals using Micro-CT.[13]

tisdag 11 december 2012

MMP, MT-MMP, .ADAM17, STAT3 silmän sarveiskalvon taudeissa

 Metalloproteinaasit sarveiskalvon eli cornean taudeissa: hajoaminen ja prosessoituminen
LÄHDE:

Sakimoto T, Sawa M. Metalloproteinases in corneal diseases: degradation and processing.
Cornea. 2012 Nov;31 Suppl 1:S50-6. doi: 10.1097/ICO.0b013e318269ccd0.
Division of Ophthalmology,

TIIVISTELMÄ (Abstract)

  • MATRIXMETALLOPROTEINAASIT ovat sinkistä (Zn++) riippuvaisia endopeptidaaseja, joilla on potentiaalia hajoittaa kaiken typpisiä extracellulaarisia matrixeja (ECM). 
Matrix metalloproteinases (MMPs) are zinc-dependent endopeptidases with the potential to degrade all types of extracellular matrix.
  •  ADAM-peptidaasiperhe,joka on  disintegriini- ja metalloproteinaasietntsyymejä, on tunnistettu äskettäin transmembraanisten (TM-) proteiinien extrasellulaarisen  domaanin pilkkojanaTätä  sanotaan  proteiinin ulkodomaanin varisemiseksi, poistippumiseksi, hilseilyksi. ( Huom EBOV GP,  glykoproteiini tarvitsee tätä ADAM17 funktiota  GP geenituotteiden muokkaamisessa)
 The ADAM (a disintegrin and metalloproteinase) family of peptidases was recently identified as cleaving the extracellular domain of transmembrane proteins.  This was termed ectodomain shedding.
  •  Tutkijat ottivat nyt selvittääkseen  sarveiskalvon tauteja potevilta potilailta  MMP-ilmenemisen ja  ADAM-entsyymiperheen mahdollisen osuuden kornean ( sarveiskalvon)  patofysiologiassa.
 We investigated the MMP expression in patients with corneal diseases and the potential role of ADAMs in corneal pathophysiology. 
  •  Tutkijat  havaitsivat   kornean sulamisesta kärsivillä   tai toistuvaa sarveiskalvoeroosiota potevilla,   että  heidän kyynelnesteessään esiintyi MMP-2 ja MMP-9  matrixmetalloproteinaasien aktiivia muotoa. 
We detected upregulation of the active form of MMP-2 and MMP-9 in the tear fluid from patients with corneal melting or recurrent corneal erosion. 
  • Sitten he  havaitsivat ihmisen sarveiskalvoepiteelin soluissa ADAM-17- peptidaaseista johtuvaa ektodomaalista  sTNFr-1 ja sIL-6R reseptorien  varisemista, hilseilemistä. 
Using human corneal epithelial cells, we observed ADAM17-dependent ectodomain shedding of soluble tumor necrosis factor receptor 1 and soluble interleukin-6 (IL-6) receptor (sIL-6R). 
  •  Liukoisen interleukiini 6-reseptorin tuotantoa indusoi mRNA-pleissi  ihmiskornean epiteelisoluissa.
The production of sIL-6R was also induced by messenger RNA splicing in the human corneal epithelial cells. 
  •  IL-6/sIL-6R- indusoimaa STAT3 -fosforylaatiota havaittiin viljellyissä ihmiskornean fibroblasteissa mikä viittaisi siihen ,että IL-6 trans-signalointi aiheutti ihmisen kornean fibroblasteihin tulehduksellisen solusignaloinnin.
IL-6/sIL-6R-induced STAT3  signal transducer and activator of transcription 3 phosphorylation was observed in cultured human corneal fibroblasts, suggesting that IL-6 trans-signaling induced inflammatory cellular signaling in the human corneal fibroblasts.
  •  Tutkijat osoittivat myös, että MMP entsyymit olivat merkitsevästi ylössäätyneinä kornean  kollageenia tuhoavissa häiriöissä. 
 We demonstrated that MMPs are significantly upregulated in collagen-destructive disorders of the cornea.
  •  Lisäksi he havaitsivat, .että ADAM-peptidaasien ektodomaalinen  hilseily kornean epiteelisoluista välitti liukoisten sytokiinireseptorien tuotantoa.
Additionally, we observed that ectodomain shedding by ADAMs in corneal epithelial cells mediated the production of soluble cytokine receptors.
  •  IL-6 Trans-signalointi saattaa aiheuttaa tulehdusvasteen sarveiskalvon stroomassa, mikä viittaa IL-6 transsignaloinnin  merkitsevyyteen  silmän pintatulehduksessa. Täten MMP ja ADAM- entsyymit ovat tärkeitä osatekijöitä sarveiskalvon tautien patofysiologiassa.
 Trans-signaling of IL-6 can induce an inflammatory response in corneal stroma, indicating the significance of IL-6 trans-signaling in ocular surface inflammation. Thus, MMPs and ADAMs play an important role in the pathophysiology of corneal diseases

LISÄYS:
ADAMS peptidaaseista,  matrix metalloproteinaaseista MMP, MT-MMP,  ja niiden inhibiitorista  TIMP,
TIMP inhibiittorista ja ADAMs entsyymien luonnollisista inhibiittoreista  tekee tutkimuksia
 Gillian Murphy et al.



Tämän ryhmän molekyylien yhteispelin ymmärtäminen on tärkeä  rheologisten kaskadien kanssa suhteissa olevana ja miltei arvaamattomana  tekijänä, joka voi  muuttaa odotettuja paranemistuloksia yhtäkkisesti  suuntaan tai toiseen- kudos voi sulaa tai parantua ennalleen
18.4. 2014 
Päivitys:
 Huomaan 18.11. että myös Ebolaviruksen GP geeni tarvitsee prosessoitumsiesna ADMA 17 isäntäsoluentsyymiä.