EBOV Gp prosessoinnissa FURIININ osuus, ADAM17 osuus .

lähde: EBOV GP (PubMed, protein) REFERENCE 8

 (residues 1 to 676)

  AUTHORS   Volchkov,V.E., Feldmann,H., Volchkova,V.A. and Klenk,H.D.
  TITLE     Processing of the Ebola virus glycoprotein by the proprotein
            convertase furin
  JOURNAL   Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 95 (10), 5762-5767 (1998)
   PUBMED   9576958
  REMARK    PROTEOLYTIC PROCESSING OF ENVELOPE GLYCOPROTEIN.

 [PTM] Specific enzymatic cleavages in vivo yield mature proteins.

 The precursor is processed into GP1 and GP2 by host cell furin in the trans Golgi, and maybe by other host proteases, to yield the mature GP1 and GP2 proteins.
The cleavage site corresponds to the furin optimal cleavage sequence [KR]-X-[KR]-R. This cleavage does not seem to be required for function.
 

• GP2 eroaa GP1:sta  501K ja 502E aminohappojen välistä FURIININ avulla.

Site 501..502 (-re-) ( kohta jossa on Arg/ Glu 

/gene="GP" /site_type="cleavage" /experiment="experimental evidence, no additional details recorded" /note="Cleavage; by host furin."

Region 502..676 (-eaivnaqpk cnpnlhywtt qdegaaigla wipyfgpaaegiyieglmhn qdglicglrq lanettqalq lflrattelr tfsilnrkai dfllqrwggt chilgpdcci ephdwtknit dkidqiihdf vdktlpdqgd ndnwwtgwrq wipagigvtg viiavialfc ickfvf)

/gene="GP" /region_name="Mature chain" /experiment="experimental evidence, no additional details recorded" /note="GP2. /FTId=PRO_0000037487." 

• Tämä FURIINILLA  irti pilkottu  osa  502-676 prosesoituu edelleen. 

 Alkuosa  runsaasta, glykocalix  materiasta( musiinin kaltaisesta  lisukkeesta)  jota  GP1 kantaa,  sievistyy  pois entsyymeillä; eihän GP1 ankkuroidu kalvopintaan itse ollenkaan.  Se tekee  vain  pientä liitosta GP2 osaan ja  vain GP2 osassa on transmembraaninen ja lyhytsytosolinen osa C-terminaali. Myös GP1,2  pilkkoutuu vielä irti ankkurista  liukoiseksi osaksi  (ADAM17)- siinä ei ole geeni materiaa

  ADAM17 endoproteaasi  pilkkoo sen   ankkuriosasta irti  Delta -GP1,2 muotoon,   liukoiseksi  sGP1,2:ksi.  jokasuuntautuu   ulospäin. GP prosessoituminen  solusaa tapahtuu erillään  replikaatio ja transkriptiotoiminnasta.- mikä selittää myös miksi  EBOV viruksella on paljon niitä tyhjiä putkia, joissa ei ole täytteenä  viruksen geenirakennelmaa.  .

 

Site 637..638 (-dq-) ADAM17 desintegrase-metalloproteaasi, TACE,Myös:  TNFalfa- convertase

                     /gene="GP"
                     /site_type="cleavage"
                     /experiment="experimental evidence, no additional details
                     recorded"
                     /note="Cleavage; by host ADAM17."

Jäljelle jää GP:n transmebraanista muotoa ja sytosoliosaa, ja ne   avaavat tien

 sytosoliin, ja virionin eväät (  valmisproteiinit  VP24, VP30, L, vRNA, NP,VP35 ja runsas   VP40, ja RNP(NP,

 L, VP35, pääsevät  solun sisään endosomikalvosta läpi) 

Region 651..671 (-wipagigvtgviiavialfc- )

/gene="GP" /region_name="Transmembrane region" /experiment="experimental evidence, no additional details recorded" /note="Helical. {ECO:0000255}."

 

Minkä tyypin entsyymi on furiini? Seriiniproteaasi FUR geeni Kr. 15q26.1

•  FURIINI on proproteiinikonvertaasi 
• Furiinin geeni  http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=Furin
•  http://en.wikipedia.org/wiki/Furin

 

 FURIINI on proteiini, jota koodaa ihmisessä  FURIINIgeeni. Nimittäin  jotkut proteiinit ovat inaktiiveja  syntetisoituessaan ja aktivoituvat vasta  kun niistä pilkkoutuu jokin osa pois.
FURIINI on sellainen tekijä, joka aktivoi  monia proteiineja sillä tavalla.
Nimensä FURIINI  sai siitä, että se havaittiin  FES- onkogeenin ylävirta-alueesta. ja sen takia  FES Upstream Region - sanoista  tehtiin FURIN lyhennys tälle kohdalle, joka koodaa FURIINIA:
FURIINI tunnetaan toisellakin nimellä  PACE, Paired basic Amino acid Cleving Enzyme, .entsyymi joka pilkkoo parilliset  baasiset aminohapot erilleen.


Furin is a protein that in humans is encoded by the FURIN gene. Some proteins are inactive when they are first synthesized, and must have sections deleted in order to become active. Furin deletes these sections and activates the proteins.^[1][2][3][4] It was named furin because it was in the upstream region of an oncogene known as FES. The gene was known as FUR (FES Upstream Region) and therefore the protein was named furin. Furin is also known as PACE (Paired basic Amino acid Cleaving Enzyme).

•  Furiinin funktio

FURIINI- geenin koodaama proteiini FURIINI  on entsyymi, joka kuuluu subtilisiinin kaltaisiin  pro-proteiinimuotojen konvertaaseihin. Siis  se on pro-proteiinikonvertaasi, joka prosessoi  latentteja prekursoreita (esimuotoisia) proteiineja niiden biologisesti aktiiveihin muotoihin. 
FURIINISSA  on kyse kalsiumista riippuvaisesta seriini-endoproteaasista, joka pystyy tehokkaasti pilkkomaan esimuotoisia proteiineja joitten rakenteessa  on parilliset baasiset aminohapot  sisältävä kohta, minkä se pystyy pilkkomaan.
FURIININ  substraatteja ovat mm.  pro-parathyreoideahormoni (Pro-PTH), TGF-beeta1 prekursori, pro-albumiini, pro-beetasekretaasi, MT1-MMP,  pro-NGF beeta alayksikkö,  vWf. 
FURIININ kaltaisen  proproteiinikonvertaasin on havaittu myös osallistuvan  RGMc (hemojuveliinin)  prosessointiin. Kyse on geenistä, joka aiheuttaa  vaikeaa  raudan liikakertymähäiriötä, juveniilia hemokromatoosia. Tutkijoitten Ganzin ja Rotweinin  työryhmät  osoittivat, että  FURIININ kaltainen proproteiinikonvertaasi (PPC) vastaa 50kDA HJV konversiosta 40 kDa proteiiniksi, jossa on typistetty  COOH-pääte.konservoidussa polybaasisessa  RNRR-kohdassa. Tässä lie  mahdollinen mekanismi HJV/hemojuveliinin  liukoisen muodon (s-juvelin) kehkeytymiseen , mitä sekä jyrsijöillä etä ihmisillä tavataan verestä. 

Function
The protein encoded by this gene is an enzyme which belongs to the subtilisin-like proprotein convertase family. The members of this family are proprotein convertases that process latent precursor proteins into their biologically active products. This encoded protein is a calcium-dependent serine endoprotease that can efficiently cleave precursor proteins at their paired basic amino acid processing sites. Some of its substrates are: proparathyroid hormone, transforming growth factor beta 1 precursor, proalbumin, pro-beta-secretase, membrane type-1 matrix metalloproteinase, beta subunit of pro-nerve growth factor and von Willebrand factor. A furin-like pro-protein convertase has been implicated in the processing of RGMc (also called hemojuvelin), a gene involved in a severe iron-overload disorder called juvenile hemochromatosis. 
Both the Ganz and Rotwein groups demonstrated that furin-like proprotein convertases (PPC) are responsible for conversion of 50 kDa HJV to a 40 kDa protein with a truncated COOH-terminus, at a conserved polybasic RNRR site. This suggests a potential mechanism to generate the soluble forms of HJV/hemojuvelin (s-hemojuvelin) found in the blood of rodents and humans.^[5][6]

•   ^{FURIINI ja HIV-virus. FURIINI on myös niistä  niistä  proteaaseista, joka  pystyy pilkkomaan HIV viruksen kalvon polyproteiiniprekursoria gp160 muotoon gp120 ja gp41 ennen kuin viruksen  koostaminen (assembly)   tapahtuu.}

 Furin is one of the proteases responsible for the proteolytic cleavage of HIV envelope polyprotein precursor gp160 to gp120 and gp41 prior to viral assembly.^[7]

•  ^{FURIINI ja tuumori   Tällä FURIINI- geenillä  arvellaan myös olevan funktiota tuumorin progredioitumisessa.Tämän geenin on havaittu käyttävän  alternatiivista polyadenylaatiota.}

 This gene is thought to play a role in tumor progression. The use of alternate polyadenylation sites has been found for this gene.^[3]

•  FURIINIA rikastuu Golgin laiteeseen, missä se toimii pilkkomalla muita proteiineja niiden kypsään ja aktiiviin muotoon. FURIINI  pilkkoo alavirtasuuntaan baasisista aminohapoista kohdesekvenssissä , kanonisesti mainitaan  RXRR tai RXKR aminohappomotiivit  FURIININ  kohdesekvensseinä.

Furin is enriched in the Golgi apparatus, where it functions to cleave other proteins into their mature/active forms.^[8] Furin cleaves proteins just downstream of a basic amino acid target sequence (canonically, Arg-X-(Arg/Lys) -Arg').

• Sen lisäksi etät FURIINI avustaa ihmiskehon solujen monia pro-proteiineja, hyvin monet patogeenit myös  kaappaavat  solutla tätä  FURIINI-apua, esim. virukset  saadakseen muokattua  kalvoproteiinejaan. HIV, Influenssavirus, denguekuume virus ja ebolavirukset kuuluvat näihin FURIININ tai FURIININ kaltaisten proteaasien  käyttäjiin.  saadakeen aíkaan  täyden funktionaalisuutensa.

 In addition to processing cellular precursor proteins, furin is also utilized by a number of pathogens. For example, the envelope proteins of viruses such as HIV, influenza and dengue fever viruses must be cleaved by furin or furin-like proteases to become fully functional.

•  Anthrax- toksiini, Pseudomonas exotoksiini ja papilloomavirus vaativat myös  FURIINI-prosesoitumisen alkuvaiheessa isäntäsoluun tullessaan. Ollaan kehittelemässä FURIININ estäjiä anthrax-infektion hoitoon.

Anthrax toxin, pseudomonas exotoxin, and papillomaviruses must be processed by furin during their initial entry into host cells. Inhibitors of furin are under consideration as therapeutic agents for treating anthrax infection.^[9]

•  Voidaan  ennakoida FURIININ  substraateja ja FURIINILLA pilkkoutuvia kohtia proteiinisekvenssissä kahdella bioinformatiikkametodilla  ProP ja PiTou.

The furin substrates and the locations of furin cleavage sites in protein sequences can be predicted by two bioinformatics methods: ProP ^[10] and PiTou.^[11]

• FURIININ ilmeneminen T-soluissa   on välttämätöntä perifeerisen immunotoleranssin ylläpidossa.

Expression of furin in T-cells is required for maintenance of peripheral immune tolerance.^[12]

• FURIININ interaktioista. FURIINI näyttää tekevän interaktion  PACS1:n kanssa.

 Furin has been shown to interact with PACS1......
( Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1 also known as PACS-1 is a protein that in humans is encoded by the PACS1 gene)