torsdag 16 oktober 2014
fredag 10 oktober 2014
Hakusana: Uncontrolled proteolysis of extracellular matrix ( 19 vastausta)
Results: 19. Katson näistä, mitä vastakeinoja esiintyy.
1.
Beaufort N, Corvazier E, Mlanaoindrou S, de Bentzmann S, Pidard D.
PLoS One. 2013 Sep 19;8(9):e75708. doi: 10.1371/journal.pone.0075708. eCollection 2013.
- PMID:
- 24069438
- [PubMed - indexed for MEDLINE]
KOMMENTTI: Artikkelissa mainittu vastaläke PHOSPHORAMIDON
Phosphoramidon is a chemical compound derived from cultures of Streptomyces tanashiensis. It is an inhibitor of the enzyme thermolysin,[2] a membrane metallo-endopeptidase inhibitor,[3] and an endothelin converting enzyme inhibitor.[3] Chemically, talopeptin differs from its closely related peptidase inhibitor talopeptin by a single stereocenter.
Because of its enzyme inhibitory properties, phosphoramidon is widely used as a biochemical tool.
2.
Botta A, Delteil F, Mettouchi A, Vieira A, Estrach S, Négroni L, Stefani C, Lemichez E, Meneguzzi G, Gagnoux-Palacios L.
J Cell Sci. 2012 Sep 15;125(Pt 18):4241-52. doi: 10.1242/jcs.096289. Epub 2012 May 28.
- PMID:
- 22641690
- [PubMed - indexed for MEDLINE]
3.
Shukla V, Kumar Shakya A, Dhole TN, Misra UK.
Neuroimmunomodulation. 2012;19(4):241-54. doi: 10.1159/000335182. Epub 2012 Mar 21.
- PMID:
- 22441541
- [PubMed - indexed for MEDLINE]
Kommentti: Tähän JEV virukseen on rokotus.
4.
Frank A, David V, Aurelie TR, Florent G, William H, Philippe B.
Anticancer Agents Med Chem. 2012 Sep;12(7):773-82. Review.
- PMID:
- 22292748
- [PubMed - indexed for MEDLINE]
5.
Barrientos LG, Rollin PE.
Virology. 2007 Feb 5;358(1):1-9. Epub 2006 Sep 18.
- PMID:
- 16982079
- [PubMed - indexed for MEDLINE]
Kommentti: Katepsiini- inhibiittoriE64, Mahdollisesti etua alkalinisaatiosta
6.
Senni
K, Gueniche F, Foucault-Bertaud A, Igondjo-Tchen S, Fioretti F,
Colliec-Jouault S, Durand P, Guezennec J, Godeau G, Letourneur D.
Arch Biochem Biophys. 2006 Jan 1;445(1):56-64. Epub 2005 Nov 28.
- PMID:
- 16364234
- [PubMed - indexed for MEDLINE]
Fucoidan voi ehkäistä virustulehdusta . http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25037398
7.
Khatib AM, Bassi D, Siegfried G, Klein-Szanto AJ, Ouafik L.
J Mol Med (Berl). 2005 Nov;83(11):856-64. Epub 2005 Aug 26. Review.
- PMID:
- 16133424
- [PubMed - indexed for MEDLINE]
8.
Dell'Agli M, Canavesi M, Galli G, Bellosta S.
Thromb Haemost. 2005 Apr;93(4):751-60. Review.
- PMID:
- 15841324
- [PubMed - indexed for MEDLINE]
9.
Danø K, Behrendt N, Høyer-Hansen G, Johnsen M, Lund LR, Ploug M, Rømer J.
Thromb Haemost. 2005 Apr;93(4):676-81. Review.
- PMID:
- 15841311
- [PubMed - indexed for MEDLINE]
Kommentti. Proteaasi-inhibiittorieden kehittely tarpeen.
10.
Chua F, Sly PD, Laurent GJ.
Pediatr Pulmonol. 2005 May;39(5):392-401. Review.
- PMID:
- 15786437
- [PubMed - indexed for MEDLINE]
11.
Stanciūte D, Didziapetriene J, Kadziauskas J.
Medicina (Kaunas). 2004;40(12):1143-50. Review. Lithuanian.
- PMID:
- 15630339
- [PubMed - indexed for MEDLINE]
12.
Skrzydlewska E.
Toxicol Mech Methods. 2003;13(4):277-93. doi: 10.1080/713857189.
- PMID:
- 20021153
- [PubMed]
13.
Bajou
K, Masson V, Gerard RD, Schmitt PM, Albert V, Praus M, Lund LR,
Frandsen TL, Brunner N, Dano K, Fusenig NE, Weidle U, Carmeliet G,
Loskutoff D, Collen D, Carmeliet P, Foidart JM, Noël A.
J Cell Biol. 2001 Feb 19;152(4):777-84.
- PMID:
- 11266468
- [PubMed - indexed for MEDLINE]
14.
Floridon C, Nielsen O, Hølund B, Sweep F, Sunde L, Thomsen SG, Teisner B.
Placenta. 2000 Nov;21(8):754-62.
- PMID:
- 11095924
- [PubMed - indexed for MEDLINE]
15.
Dear AE, Medcalf RL.
Biochim Biophys Acta. 2000 Jun 21;1492(1):15-22.
- PMID:
- 11004477
- [PubMed - indexed for MEDLINE]
Kommentti: Oxamflatin vähentää u-PA:sta johtuvaa proteolyyttistä aktiivisuutta.
16.
Owen CA, Campbell EJ.
J Leukoc Biol. 1999 Feb;65(2):137-50. Review.
- PMID:
- 10088596
- [PubMed - indexed for MEDLINE]
17.
Weckroth M, Vaheri A, Lauharanta J, Sorsa T, Konttinen YT.
J Invest Dermatol. 1996 May;106(5):1119-24.
- PMID:
- 8618050
- [PubMed - indexed for MEDLINE]
18.
Liotta LA, Stetler-Stevenson WG.
Cancer Res. 1991 Sep 15;51(18 Suppl):5054s-5059s. Review.
- PMID:
- 1884381
- [PubMed - indexed for MEDLINE]
19.
Castronovo V, Stetler-Stevenson WG, Sobel ME, Liotta LA.
Princess Takamatsu Symp. 1991;22:319-37. Review.
- PMID:
- 1844249
- [PubMed - indexed for MEDLINE]
onsdag 8 oktober 2014
MMP-kaskadi- Plg-Plasminkaskadi ja Katepsiinit samassa kuvassa
ProkatepsiiniB(pro-CB) aktivoituu kudostyyppisellä plasminogeeniaktivaattorilla (tPA) ja katepsiiniD.llä aloittaen proteolyyttisen kaskadin, joka johtaa urokinaasityyppisen plasminogeeniaktivaatorin (uPA) aktivoitumiseen, aktiivien matrixmetalloproteinaasien (MMPs) kehkeytymiseen ja plasminogeenin aktivoitumiseen plasmiiniksi.
Pro-CB asettuu annexiiniII tetrameeriin, jonka kiinnittymiseen plasmakalvoon vaaditaan aktiivia kalsiumjonia (Ca++). AnneksiiniIItetrameeri tekee interaktion kudosperäisen plasminogeeniaktivaatorin (tPA) , kollageenin ja tenaskiinin (TNC) kanssa.
p11, joka sitoutuu anneksiiniIItetrameeriin (AIIt) solun pinnalla tekee interaktion plasminogeenin ja pro katepsiini B:n (Pro-CB) kanssa eri sitoutumiskohdilla.
Tällainen proteaasien saman paikkaan lokalisoituminen AIIt:n kanssa voisi kiihdyttää proentsyymien proteolyyttistä kaskadia ja matrixkomponenttien selektiivistä hajoamista.
Kollektiivisesti toimiessaan aktiivit proteaasit voivat hajoittaa kaikki extrasellulaarisen matrixin komponentit. Siis ECM suojauksessa täytyy inhibition kohdistua monikerroksisesti kaikkiin näihin kaskadeihin MMP, PLG-plasmin- tPA-uPA ja katepsiinit. Sen minkä ebola tekee päivissä, syöpä tekee kuukausissa ja vuosissa näillä. - Ja kaikessa tulee kuitenkin katsoa rheologinen välttämätön systeeminen funktionaalisuus Haastavaa koota niin moninaista lääkitystä ECM tuhon estoon, mikä vaditaan ebolassa.
Pro-cathepsin B (Pro-CB) is activated by tissue-type plasminogen activator (tPA) and cathepsin D, initiating a proteolytic cascade that results in the activation of urokinase-type plasminogen activator (uPA), matrix metalloproteinases (MMPs) and plasmin. Pro-CB is situated on the annexin II tetramer (AIIt). Binding of annexin II to the plasma membrane is Ca2+-dependent. Although the mechanism is unclear, AIIt is known to interact with tPA, collagen I and tenascin C (TNC). p11, which binds to AIIt on the cell surface, has been shown to interact with plasminogen and pro-CB at different binding sites. Co-localization of proteases with AIIt would facilitate the activation of pro-enzymes in a proteolytic cascade and the selective degradation of matrix components. Collectively, active proteases can degrade all of the components of the extracellular matrix.
Filovirukset yleensäkin vaativat isäntäsolun endosomaalisia kysteiiniproteaaseia sisäänmenoon.
J Virol. 2012 Mar;86(6):3284-92. doi: 10.1128/JVI.06346-11. Epub 2012 Jan 11. Filoviruses require endosomal cysteine proteases for entry but exhibit distinct protease preferences.
Misasi J1, Chandran K, Yang JY, Considine B, Filone CM, Côté M, Sullivan N, Fabozzi G, Hensley L, Cunningham J.
Abstract
Filoviruses
are enveloped viruses that cause sporadic outbreaks of severe
hemorrhagic fever [CDC, MMWR Morb. Mortal. Wkly. Rep. 50:73-77, 2001;
Colebunders and Borchert, J. Infect. 40:16-20, 2000; Colebunders et al.,
J. Infect. Dis. 196(Suppl. 2):S148-S153, 2007; Geisbert and Jahrling,
Nat. Med. 10:S110-S121, 2004]. Previous studies revealed that endosomal
cysteine proteases are host factors for ebolavirus Zaire (Chandran et
al., Science 308:1643-1645, 2005; Schornberg et al., J. Virol.
80:4174-4178, 2006). In this report, we show that infection mediated by
glycoproteins from other phylogenetically diverse filoviruses are also
dependent on these proteases and provide additional evidence indicating
that they cleave GP1 and expose the binding domain for the critical host
factor Niemann-Pick C1. Using selective inhibitors and knockout-derived
cell lines, we show that the ebolaviruses Zaire and Cote d'Ivoire are
strongly dependent on cathepsin B, while the ebolaviruses Sudan and
Reston and Marburg virus are not. Taking advantage of previous studies
of cathepsin B inhibitor-resistant viruses (Wong et al., J. Virol.
84:163-175, 2010), we found that virus-specific differences in the
requirement for cathepsin B are correlated with sequence polymorphisms
at residues 47 in GP1 and 584 in GP2. We applied these findings to the
analysis of additional ebolavirus isolates and correctly predicted that
the newly identified ebolavirus species Bundibugyo, containing D47 and
I584, is cathepsin B dependent and that ebolavirus Zaire-1995, the
single known isolate of ebolavirus Zaire that lacks D47, is not. We also
obtained evidence for virus-specific differences in the role of
cathepsin L, including cooperation with cathepsin B. These studies
strongly suggest that the use of endosomal cysteine proteases as host
factors for entry is a general property of members of the family
Filoviridae.
Ebolan tekemää soluvauriota pahentaa soluproteaasien vapautuminen hapantuvaan solunulkomiljööseen
LÄHDE: Virology. 2007 Feb 5;358(1):1-9. Epub 2006 Sep 18. Release of cellular proteases into the acidic extracellular milieu exacerbates Ebola virus-induced cell damage.
TIIVISTELMÄ Abstract
Solua kovasti vaurioittava ebolavirus toimii suurimmaksi osaksi tuntemattomalla mekanismilla.
Tässä tutkijat vuonna 2007 koettavat antaa näyttöä siitä, että progressiivinen happamuuden kasvu solunulkoisessa miljöössä ( asidoottisuus), mitä ebolalla varurioitunut solu aiheuttaa- ja samalla vähentyneet pitoisuudet luonnollisia cysteiiniproteaasi-estäjiä tekevät solut vaurioalttiiksi aivan kontrolloimattomalle extrasellulaarisen matrixin (ECM) osasten proteolyysille ( eli solunulkomatrixin hajoamiselle) vapautuneitten aktiivien endosomaalisten katepsiinien kautta ja täten edelleen pahenee ebolaviruksen aiheuttama solutuho.
Tässä aktiivisuudessa on osoittautunut kriittiseksi solupinnan mikromiljöö. Jos voidaan blokeerata katepsiininestäjällä, tuo proteolyyttinen( valkuaista hajoittava) aktiivisuus, saadaan huomattavaa paranemista, mitä tulee viruksen sytopaattisuuteen ja solun elossapysymiseen, vaikka viruslasti rasitus olisikin huima
Tässä tutkijat vuonna 2007 koettavat antaa näyttöä siitä, että progressiivinen happamuuden kasvu solunulkoisessa miljöössä ( asidoottisuus), mitä ebolalla varurioitunut solu aiheuttaa- ja samalla vähentyneet pitoisuudet luonnollisia cysteiiniproteaasi-estäjiä tekevät solut vaurioalttiiksi aivan kontrolloimattomalle extrasellulaarisen matrixin (ECM) osasten proteolyysille ( eli solunulkomatrixin hajoamiselle) vapautuneitten aktiivien endosomaalisten katepsiinien kautta ja täten edelleen pahenee ebolaviruksen aiheuttama solutuho.
- Ebola virus is highly cytopathic through mechanisms that are largely unknown. We present evidence that progressive acidification of the extracellular milieu by Ebola virus-infected cells combined with reduced levels of natural cysteine protease inhibitor makes the cells vulnerable to uncontrolled proteolysis of extracellular matrix components by released active endosomal cathepsins, thereby exacerbating Ebola virus-induced cell destruction.
Tässä aktiivisuudessa on osoittautunut kriittiseksi solupinnan mikromiljöö. Jos voidaan blokeerata katepsiininestäjällä, tuo proteolyyttinen( valkuaista hajoittava) aktiivisuus, saadaan huomattavaa paranemista, mitä tulee viruksen sytopaattisuuteen ja solun elossapysymiseen, vaikka viruslasti rasitus olisikin huima
- The cell surface microenvironment was shown to be crucial in aiding this activity. Blocking the proteolytic activity with the cathepsin inhibitor E64 resulted in remarkable improvements with respect to viral cytopathicity and cell survival despite an overwhelmingly high viral load.
- We propose that the observed enzymatic matrix degradation, enhanced by an associated protease/inhibitor imbalance and metabolic acidosis, represents an effective viral strategy to boost infection and underlies, in part, the remarkable pathogenesis caused by Ebola virus.
- Further in vitro and in vivo research will establish whether a cellular protease with hemorrhagic activity is the leading cause of vascular leakage-the hallmark of Ebola virus hemorrhagic fever-and help understand the
Free full text
Kysteiiniproteaasit ja niiden inhibiittorit
Lundista:
KYSTEIINIPROTEAASEJA on neljä luokkaa poroteolyyttisiä entsyymejä: Niitä on 30:stä proteiiniperheessä.
Perhe C1: Papaiiniperhe:
Katepsiini B, Katepsiini L (, joilla on osuutta syövässä); Katepsiini K( osuutta luun hajoamisessa) ja loisten entsyymeitä, jotka vaikuttavat loisen ja isännän interaktiossa ( esim cruzipaiini Trypanosoma cruzi-loisesta, joka aiheuttaa Chagan tautia) .(huom: Ebola aiheuttaa solun endosomeista katepsiinien vapautumista)
Cysteine proteases are one of the four major classes of proteolytic enzymes. Based on 3D structures they are grouped in more than 30 protein families. Family C1 (the papain family) include cathepsins B and L (cancer involvement), cathepsin K (bone degradation) and parasitic enzymes essential for the parasite-host interaction (e.g., cruzipain from Trypanosoma cruzi; causing Chagas disease).
Perhe C13 (legumaiiniperhe) toimii antigeenin esityksessä .
Family C13 (the legumain family) enzymes play key roles in antigen presentation
Perhe C14 ( kaspaasiperhe) välittää apoptoosia.
and those of Family C14 (the caspase family) are mediators of apoptosis.
Patogeenien bakteerien monet proteaasit ovat virulenssifaktoreista ja aiheuttavat vaikeita ongelmia isäntäkehossa infektion aikana:
Many proteases of pathogenic bacteria are virulence factors and cause severe problems for the host at infections,
Perhe25: gingipaiiniperhe periodontiittia aiheuttavasta Porfyromonas gingivalis bakteerista.
such as gingipains (Family C25) of Porhyromonas gingivalis in periodontitis,
Perhe C25. streptopaiiniperhe Streptococcus pyogenes bakteerista.
streptopain (Family C10) from Streptococcus pyogenes
Perhe C47 , staphopaiinit Staphylococcus aureuksesta.
and staphopains (Family C47) from Staphylococcus aureus.
Natural inhibitors of proteases are normally small proteins with structures highly complementary to the substrate-binding clefts of their target enzymes. Because of the need for a good fit, they can generally only bind to enzymes of a single protease family.
Tutkijaryhmä on aiemmin selvittänyt 12 ihmisen kystatiinia, jotka toimivat perhe C1 proteaasien inhibiittoreina.
Our previous work has dealt with identification and molecular characterisation of the 12 human cystatins being natural inhibitors of Family C1 proteases.
Tuoreempia tutkimuksia on legumaiiniperheen proteaasien luonnollisten proteiini-estäjien tutkimukset. Samoin on tutkittu myös lääketieteellisesti tärkeitä kysteiiniproteaaseja kuten sellaisia, joita tulee loisista ja bakteereista ( erityisesti stafylokokista) Tästä saa vihjettä sellaisten tautien hoitoon tarkoitettujen lääkeaineiden kehittelyyn, missä on piirteenä mainittujen entsyymien lisääntynyt aktiivisuus.
More recent studies aim at characterisation of natural protein inhibitors of proteases of the legumain family and other medically important cysteine proteases, such as those of parasites and bacteria (with special focus on Staphylococcus aureus). The methods we use range from those of basic genetics over protein chemistry to cell biology.
Molecular characterisation of various protein inhibitors of human, parasitic and bacterial cysteine proteases provides clues to development of agents for therapy of diseases characterised by increased activities of such enzymes.
Eräässä alaprojektissa stafylokokin proteolyyttinen järjestelmä on luonnehdittuna molekyylitasolla ja ollaan tunnistamassa sille isäntäkehosta ja bakteerisoluista luonnollisia proteiini-estäjiä Tästä saataneen kehiteltyä aineita, joilla päästään ehkä vaikuttamaan kautta maailman sairaaloitten nopeasti leviävien antibiooteille resistenttien kantojen kasvuun ja virulenssiin
In one subproject, the proteolytic system of Staphylococcus aureus is characterised at the molecular level and natural protein inhibitors in host and bacterial cells will be identified. This could allow development of agents which interfere with growth/virulence of antibiotic resistant strains rapidly spreading in hospitals worldwide.
Link to project homepage: http://www.med.lu.se/labmedlund/klinisk_kemi_och_farmakologi/forskning/magnus_abrahamson/homepage
KYSTEIINIPROTEAASEJA on neljä luokkaa poroteolyyttisiä entsyymejä: Niitä on 30:stä proteiiniperheessä.
Perhe C1: Papaiiniperhe:
Katepsiini B, Katepsiini L (, joilla on osuutta syövässä); Katepsiini K( osuutta luun hajoamisessa) ja loisten entsyymeitä, jotka vaikuttavat loisen ja isännän interaktiossa ( esim cruzipaiini Trypanosoma cruzi-loisesta, joka aiheuttaa Chagan tautia) .(huom: Ebola aiheuttaa solun endosomeista katepsiinien vapautumista)
Cysteine proteases are one of the four major classes of proteolytic enzymes. Based on 3D structures they are grouped in more than 30 protein families. Family C1 (the papain family) include cathepsins B and L (cancer involvement), cathepsin K (bone degradation) and parasitic enzymes essential for the parasite-host interaction (e.g., cruzipain from Trypanosoma cruzi; causing Chagas disease).
Perhe C13 (legumaiiniperhe) toimii antigeenin esityksessä .
Family C13 (the legumain family) enzymes play key roles in antigen presentation
Perhe C14 ( kaspaasiperhe) välittää apoptoosia.
and those of Family C14 (the caspase family) are mediators of apoptosis.
Patogeenien bakteerien monet proteaasit ovat virulenssifaktoreista ja aiheuttavat vaikeita ongelmia isäntäkehossa infektion aikana:
Many proteases of pathogenic bacteria are virulence factors and cause severe problems for the host at infections,
Perhe25: gingipaiiniperhe periodontiittia aiheuttavasta Porfyromonas gingivalis bakteerista.
such as gingipains (Family C25) of Porhyromonas gingivalis in periodontitis,
Perhe C25. streptopaiiniperhe Streptococcus pyogenes bakteerista.
streptopain (Family C10) from Streptococcus pyogenes
Perhe C47 , staphopaiinit Staphylococcus aureuksesta.
and staphopains (Family C47) from Staphylococcus aureus.
PROTEAASIEN LUONNOLLISET ESTÄJÄT
Nämä ovat normaalisti pieniä proteiineja , joiden rakenne on korkea-asteisesti komplementaarinen kohde-entsyymien substraattia sitoviin loviin. Koska niiden täytyy olla päteviä, niin ne voivat yleensäkin sotoa vain yksittäisen proteaasiperheen entsyymejä.Natural inhibitors of proteases are normally small proteins with structures highly complementary to the substrate-binding clefts of their target enzymes. Because of the need for a good fit, they can generally only bind to enzymes of a single protease family.
Tutkijaryhmä on aiemmin selvittänyt 12 ihmisen kystatiinia, jotka toimivat perhe C1 proteaasien inhibiittoreina.
Our previous work has dealt with identification and molecular characterisation of the 12 human cystatins being natural inhibitors of Family C1 proteases.
Tuoreempia tutkimuksia on legumaiiniperheen proteaasien luonnollisten proteiini-estäjien tutkimukset. Samoin on tutkittu myös lääketieteellisesti tärkeitä kysteiiniproteaaseja kuten sellaisia, joita tulee loisista ja bakteereista ( erityisesti stafylokokista) Tästä saa vihjettä sellaisten tautien hoitoon tarkoitettujen lääkeaineiden kehittelyyn, missä on piirteenä mainittujen entsyymien lisääntynyt aktiivisuus.
More recent studies aim at characterisation of natural protein inhibitors of proteases of the legumain family and other medically important cysteine proteases, such as those of parasites and bacteria (with special focus on Staphylococcus aureus). The methods we use range from those of basic genetics over protein chemistry to cell biology.
Molecular characterisation of various protein inhibitors of human, parasitic and bacterial cysteine proteases provides clues to development of agents for therapy of diseases characterised by increased activities of such enzymes.
Eräässä alaprojektissa stafylokokin proteolyyttinen järjestelmä on luonnehdittuna molekyylitasolla ja ollaan tunnistamassa sille isäntäkehosta ja bakteerisoluista luonnollisia proteiini-estäjiä Tästä saataneen kehiteltyä aineita, joilla päästään ehkä vaikuttamaan kautta maailman sairaaloitten nopeasti leviävien antibiooteille resistenttien kantojen kasvuun ja virulenssiin
In one subproject, the proteolytic system of Staphylococcus aureus is characterised at the molecular level and natural protein inhibitors in host and bacterial cells will be identified. This could allow development of agents which interfere with growth/virulence of antibiotic resistant strains rapidly spreading in hospitals worldwide.
Link to project homepage: http://www.med.lu.se/labmedlund/klinisk_kemi_och_farmakologi/forskning/magnus_abrahamson/homepage
Prenumerera på:
Inlägg (Atom)