ADAM- molekyyleistä

https://www.researchgate.net/publication/301638469_A_Disintegrin_and_Metalloprotease_ADAM_Historical_Overview_of_Their_Functions

• Article· Literature Review (PDF Available) in Toxins 8(5):122 · April 2016 with 114 Reads

  DOI: 10.3390/toxins8040122
Nives Giebeler


Suomennosta tiivistelmästä 


 Senjälkeen kun  oli löydetty  ensimmäinen disintegriiniproteiini käärmeen myrkystä ja oli myös tunnistettu nisäkkäiltä kalvoon ankkuroitunut metalloproteinaasi-disintegriini, jolla on tehtäviä fertilisaatiossa, seurasi kolme vuosikymmentä tutkimusten aikaa ja tunnistettiin  runsaasti näiden  proteinaasiperheiden jäseniä ja useita biokemiallisia mekanismeja, jotka säätivät niiden ilmenemistä solussa  ja aktiivisuutta. 
Mikä tärkeintä  on  myös tunnistettu näiden proteiinien  in vivo-funktioita- kuten  niiden osallistuminen solujen jakaantumiseen kehityksen aikana,  niiden tulehdsreaktioita moduloiva vaikutus  ja niiden osallistuminen syövän syntyyn. 
Tässä katsauksessa  tehdään yleisnäkymää ADAM-proteaasien perheestä  ( ADAM on lyhennys  englantilaisista sanoista , jotka tarkoittavat:  "eräs disintegriini ja metalloproteaasi") ja valaistaan  muutamia  tärkeimpiä tutkimussaavutuksia ADAM-proteinaasien  analyyseistä , mitkä painottavat näiden proteiinien  tärkeyttä  fysiologisissa ja patologisissa prosesseissa  ajan mittaan. 
• Abstract
Since the discovery of the first disintegrin protein from snake venom and the following identification of a mammalian membrane-anchored metalloprotease-disintegrin implicated in fertilization, almost three decades of studies have identified additional members of these families and several biochemical mechanisms regulating their expression and activity in the cell. Most importantly, new in vivo functions have been recognized for these proteins including cell partitioning during development, modulation of inflammatory reactions, and development of cancers. In this review, we will overview the a disintegrin and metalloprotease (ADAM) family of proteases highlighting some of the major research achievements in the analysis of ADAMs' function that have underscored the importance of these proteins in physiological and pathological processes over the years.
Muistiin  13.3. 2019  


KLOMEMNTTI:
Näitä ADAM-proteiineja on luomakunnassa   monilla, mutta ihmisillä  on lueteltu  numeroon 33 asti, vaikka  myöhemmin on jouduttu tekemään pieniä muutoksia  luetteloon, tarkennettu, jos onkin kyse pseudogeenistä  ja yhdistetty jokin  ADAM -proteiini saman  nimen alle. moni ADAmgeeni esiintyy  klustereina. . 


PubMed hakulaiteesta Geenien  luettelosta löytyy seuraavia ihmisten ADAM- proteinaaseja. 
Ihmisen ADAM-proteiinit ja geenit tänään 13.3. 2019 PubMed hakuna ja  yhtenvetona kromosomittain. 


1. Kromosomi
ADAM15,  (1q21.3)  MDC15
 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/NP_001248393.1
vain tällä metargidiini ADAM- metalloproteinaasilla on RGD- aminohapposekvenssi disintegriinidomeenissa ja sen takia  se  voi sitoa integriiniä.

ADAM30,  (1p12) ,svph4
 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/11085
Tämä geeni  on  testisspesifinen. 
2.  Kromosomi
ADAM17, (2p25.1)  CD156B, CSVP, NISBD, NISBD1, TACE  (TNFalpha converting enzyme, TNFa Convertase) .
 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/30069943
Kehitetty inhibiittori ZLDI-8, joka estää ADAM17- ja  samalla Notch-signalointia, koska Notch on eräs  ADAM17- substraateista. 


ADAM23, (2q33.3)  MDC3
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/8745
Geeni ilmenee aivoissa ja sydämessä eniten. . 
4 Kromosomi
ADAM29, ( 4q34.1) CT73 (cancer/testis antigen 73) , svph1
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/11086 
ADAM 29 ja ADAM7 ovat usein mutatoituneet melanomassa. 
5 Kromosomi
ADAM19. (5q33.3)  FKSG34, MADDAM (Metalloproteinase And Disintegrin Dendritic Antigen Marker) , MLTNB (Meltrin beta), Dendriittisolun kypsymisen merkitsijä.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/8728
7 Kromosomi
ADAM22, (7q21.12)   EIEE61, MDC2 (Early Infantile Epileptic Encephalopathy 61)
Tämä ADAM22 ei omaa sinkkiä sitovaa motiivia ja sen takia siltä puuttuu  metalloproteinaasiominaisuus. Sitä esiintyy paljon aivosissa ja arvellaan että  se toimii integriiniligandina. Hiirillä sen on havaittu  vaikuttavan virheetöntä myelinisaatiota ja tarkkaa  synaptista  transmissiota.   Funktion  disruptio aivoissa vikuuttaa AMPA-reseptorien  funktiota , mikä selittää osaltaan   epileptisyyttä.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/53616
8. Kromosomi
ADAM2 ( 8p11.22), CRYN1, CRYN2,CT15 (cancer/testis antigen 15), FTNB ( fertilin subunit beta), , PH-30-P, PH30, PH-30-beta
 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/2515


ADAM3A, pseudogeeni   (8p11.22) , ADAM3, CYRN1 (cyritestin 1) , IMDC1, restricted expr. towards testis(pseudogene). Homozyg. puute: pons gliomariski.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/1587


ADAM5, (8p11.22) ADAMSP, TMDCII, restricted towards testis, pseudogene.

* Cluster:  8p21.2  :  ADAM7, ADAM28, ADAMDEC1:

*ADAM7 (8p21.2) , ADAM-7, EAP1 (epididymal apical protein 1) , GP-83, GP83(sperm maturation related glycoprotein 83)  Mutatoitunut   ADAM7 usein  melanomassa.
 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/8756

ADAM- perheen alaperheeseen kuuluu    immuunifunktion hankkinut decysiini,
Klusterin  jäsenillä on  samankaltaisia omnaisuuksia,.

• *ADAMDEC1 (8p21.2)  (decysin ) https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/12037602/ 
•  https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/10863  
• Metzincin- metalloproteinaasi.  Mieto proteinaasi.  Tuottaa  aktiivia EGF  verihiutaleista. tärkeä monosyyttien erilaistumisessa  ja DC solujen solujen kypsymisessä.  Vaikuttaa  reologiaan. Kiinnostava linkki! 2000 löytynyt alaperhe. Se eroaa ADAM-perheestä siten, että  siltä puuttuu osittain disintegriinidomeeni ja  cysteiinidomeeni puuttuu kokonaan, mistä nimi: decysiini. Tämä geeni on  evoloitunut  geeniduplikaatiolla  metalloproteinaasigeeniklusterissa  8p12  kohalla.  Vaikka  tämä geeni menetti metalloproteinaasiominaisuuksia,  se hankki immuunifunktioita.

 *ADAM28  (8p21.2) MDC-L (metalloproteinaasin kaltainen, disintegriinin kaltainen- cysteiinipitoisen kaltainen proteiini) MDCL, MDCII, eMDCII (epididymal) . Omaa immuunifunktiota ja kuuluu yllämainittuun geeniklusteriin. 
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/10863

ADAM9 (8p11.22)  CORD9 (Cone rod dystrophy 9) , MCMP  (Myeloma Cell metalloproteinase) , MDC9, Mltng
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/8754

ADAM18, (8p11.22)  ADAM27, tMDCIII ( Mature sperm surface protein)
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/8749


ADAM24 (8p22), replaced with gene ADAM24P, pseudogeeni
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/8745


ADAM32 (8p11.22) , MMP-12- kaltainen, testiskudosproteiini Li13.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/203102
10. Kromosomi
ADAM8 (10q26.3) , CD156, CD156a, MS2 (solupinta-antigeeni) , ihmisen leukosyyttidifferentiaation antigeeni,  osallistuu temozolomide- kemoresistenssiin.
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/101


ADAM12, (10q26.2)  ADAM12-OT1, CAR10, MCMP, MCMPMltna, MLTN, MLTNA (meltrin alpha)(Maternal serum marker for pre-natal development)
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/8038 
12. Kromosomi
ADAM1A, pseudogeeni  /12q24.12q24.13.   ADAM1, ADAM1P, FTNAP, Ftna, PH-30a, Fertilin alpha, pseudogene https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/8759
14. Kromosomi
ADAM6, pseudogeeni(14q32.33) , tMDCIV, C14orf96
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/?term=ADAM6
 
ADAM20 (14q24.2) 
 fertiliini alfan  kaltainen, testisspesifinen. kuten ADAM21
 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/8748

 ADAM21 (14q24.2)
fertiliini alfan kaltainen, myöstestisspesifinen. Myös nimi: ADAM31.
15- Kromosomi
ADAM10, (15q21.3) , AD10, AD18, CD156c, CDw156, HST-187, MADM (mammalian disintegrin metalloprioteinase), RAK (reticulate acropigmentation of  Kitamura) , Kuz ( Kuzbanim protein homolog)
Tämä metalloproteinaasi  proteiini pilkkoo TNF-alfaa ja E-cadherinia.
 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/102
17. Kromosomi
ADAM 11,  (17q21.31). MDC ( Metalloproteinase, Disintegrin, Cystein- rich protein). Proteiinia ilmenee runsaasti  runsaasti  aivoissa. Geenin  sijainnin takia rintasyövän kandidaattigeenejä.
20. Kromosomi
ADAM33 (20p13), C20orf153, DS964F7.1
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/80332
Tämä proteiiniassosioituu astmaan ja hyperreaktiivisuuteen. 

Muistiin  14.3. 2019