Etiketter

Visar inlägg med etikett STAT3. Visa alla inlägg
Visar inlägg med etikett STAT3. Visa alla inlägg

onsdag 12 mars 2014

Onko yhteistä nimittäjää surviviinilla ja TIMP-1:llä Löytyy STAT3 välitteisyys. Lisätieto TIMP1 geenistä

http://ajcp.ascpjournals.org/content/127/5/770.full.pd

Tämä ylläoleva  artikkeli selvittelee anaplastista  suurisoluista lymfomaa (ACLC) . Siinä ilmenee  tuumoreille tavallinen aktivoiva kinaasi ALK. Kuitenkaan se  kinaasi ei korreloi surviviiniin.  Mutta nythän on löydetty kinaasij joka korreloi: ( Kts. se uusi väitöskirja).

Kuitenkin tuosta ylläolevasta lähteestä löytyy surviviinista olennaista tietoa:
SURVIVIINI  on normaali proteiini  sikiökehityksen aikana proliferoituvissa soluissa  ja kuuluu apoptoosia estäviin proteiineihin. Mutta  differentioituneissa aikuissoluissa sitä ei pitäisi olla.
 Surviviini on  STAT3- tekijän kohdemolekyylejä  (kuten myös TIMP-1 metalloproteinaasien inhibiittorimolekyyli).

Erityistä on että jos TIMP-1 säätyy ylös , se on  antiapoptoottinen ja kasvua edistävä ja sitä havaitaan monissa tuumoreissa ja se on prognostisesti  epäedullinen löytö. .Sitä on stroomassa.

Siis jos nämä molemmat STAT3 välitteiset  ovat säätyneinä ylös,  seuraa   seka solun ja tuman puoella, että stroomassa  antiapoptoottisuudesta ja kasvua edistävästä vaikutuksesta tumorööttistä kasvua.

SURVIVIINI  on  molekyyli joka pystyy sukkuloimaan sytoplasman ja tuman välillä, se on ns. nuclear shuttle protein. omine  expost- import tahteineen.  Sen rakenne  on tosi viehättävän näköinen, kuin jokin vieteri.

Jos merkataan pSTAT ja mitataan, on havaittu että  sen pitoisuus korreloi surviviinin pitoisuuteen.

Anaplastisessa lymfoomassa  on useat signalointitiet  menneet säätelyltään epäkuntoon ja sitten myös  vaikuttuu monet alavirran kohdemolekyylit  apotoosin kontrollijärjestelmässä ja solukasvun kontrollijärjestelmässä kuten  bcl-xL, bcl-2, kaspaasi3, sykliiniD3, c-myc. Mcl-1, sytokiinisignaaliensuppressori3 ja surviviini onkogeenien joukossa. 

Otin siteerauksen TIMP1:n  geenikartasta, kun huomasin  että TIMP-1 on vain X- kromosomissa, kun taas Survivin on  somaatisessa kromosomissa 17.

 Entrez Gene summary for TIMP1 Gene:



This gene belongs to the TIMP gene family. The proteins encoded by this gene family are natural inhibitors of the matrix metalloproteinases (MMPs), a group of peptidases involved in degradation of the extracellular matrix. In addition to its inhibitory role against most of the known MMPs, the encoded protein is able to promote cell proliferation in a wide range of cell types, and may also have an anti-apoptotic function. Transcription of this gene is highly inducible in response to many cytokines and hormones. In addition, the expression from some but not all inactive X chromosomes suggests that this gene inactivation is polymorphic in human females. This gene is located within intron 6 of the synapsin I gene and is transcribed in the opposite direction. (provided by RefSeq, Jul 2008)

GeneCards Summary for TIMP1 Gene: 
TIMP1 (TIMP metallopeptidase inhibitor 1) is a protein-coding gene. Diseases associated with TIMP1 include lymphoma, large-cell, immunoblastic, and oral submucous fibrosis, and among its related super-pathways are Inhibition of Matrix Metalloproteinases and Rac1 Pathway. GO annotations related to this gene include metalloendopeptidase inhibitor activity and metal ion binding. An important paralog of this gene is TIMP4.

UniProtKB/Swiss-Prot: TIMP1_HUMAN, P01033
Function: Complexes with metalloproteinases (such as collagenases) and irreversibly inactivates them by binding to their catalytic zinc cofactor. Also mediates erythropoiesis in vitro; but, unlike IL-3, it is species-specific, stimulating the growth and differentiation of only human and murine erythroid progenitors. Known to act on MMP-1, MMP-2, MMP-3, MMP-7, MMP-8, MMP-9, MMP-10, MMP-11, MMP-12, MMP-13 and MMP-16. Does not act on MMP-14

Päivitysät 18.4. 2014

tisdag 11 december 2012

MMP, MT-MMP, .ADAM17, STAT3 silmän sarveiskalvon taudeissa

 Metalloproteinaasit sarveiskalvon eli cornean taudeissa: hajoaminen ja prosessoituminen
LÄHDE:

Sakimoto T, Sawa M. Metalloproteinases in corneal diseases: degradation and processing.
Cornea. 2012 Nov;31 Suppl 1:S50-6. doi: 10.1097/ICO.0b013e318269ccd0.
Division of Ophthalmology,

TIIVISTELMÄ (Abstract)

  • MATRIXMETALLOPROTEINAASIT ovat sinkistä (Zn++) riippuvaisia endopeptidaaseja, joilla on potentiaalia hajoittaa kaiken typpisiä extracellulaarisia matrixeja (ECM). 
Matrix metalloproteinases (MMPs) are zinc-dependent endopeptidases with the potential to degrade all types of extracellular matrix.
  •  ADAM-peptidaasiperhe,joka on  disintegriini- ja metalloproteinaasietntsyymejä, on tunnistettu äskettäin transmembraanisten (TM-) proteiinien extrasellulaarisen  domaanin pilkkojana.  Tätä  sanotaan  proteiinin ulkodomaanin varisemiseksi, poistippumiseksi, hilseilyksi. ( Huom EBOV GP,  glykoproteiini tarvitsee tätä ADAM17 funktiota  GP geenituotteiden muokkaamisessa)
 The ADAM (a disintegrin and metalloproteinase) family of peptidases was recently identified as cleaving the extracellular domain of transmembrane proteins.  This was termed ectodomain shedding.
  •  Tutkijat ottivat nyt selvittääkseen  sarveiskalvon tauteja potevilta potilailta  MMP-ilmenemisen ja  ADAM-entsyymiperheen mahdollisen osuuden kornean ( sarveiskalvon)  patofysiologiassa.
 We investigated the MMP expression in patients with corneal diseases and the potential role of ADAMs in corneal pathophysiology. 
  •  Tutkijat  havaitsivat   kornean sulamisesta kärsivillä   tai toistuvaa sarveiskalvoeroosiota potevilla,   että  heidän kyynelnesteessään esiintyi MMP-2 ja MMP-9  matrixmetalloproteinaasien aktiivia muotoa. 
We detected upregulation of the active form of MMP-2 and MMP-9 in the tear fluid from patients with corneal melting or recurrent corneal erosion. 
  • Sitten he  havaitsivat ihmisen sarveiskalvoepiteelin soluissa ADAM-17- peptidaaseista johtuvaa ektodomaalista  sTNFr-1 ja sIL-6R reseptorien  varisemista, hilseilemistä. 
Using human corneal epithelial cells, we observed ADAM17-dependent ectodomain shedding of soluble tumor necrosis factor receptor 1 and soluble interleukin-6 (IL-6) receptor (sIL-6R). 
  •  Liukoisen interleukiini 6-reseptorin tuotantoa indusoi mRNA-pleissi  ihmiskornean epiteelisoluissa.
The production of sIL-6R was also induced by messenger RNA splicing in the human corneal epithelial cells. 
  •  IL-6/sIL-6R- indusoimaa STAT3 -fosforylaatiota havaittiin viljellyissä ihmiskornean fibroblasteissa mikä viittaisi siihen ,että IL-6 trans-signalointi aiheutti ihmisen kornean fibroblasteihin tulehduksellisen solusignaloinnin.
IL-6/sIL-6R-induced STAT3  signal transducer and activator of transcription 3 phosphorylation was observed in cultured human corneal fibroblasts, suggesting that IL-6 trans-signaling induced inflammatory cellular signaling in the human corneal fibroblasts.
  •  Tutkijat osoittivat myös, että MMP entsyymit olivat merkitsevästi ylössäätyneinä kornean  kollageenia tuhoavissa häiriöissä. 
 We demonstrated that MMPs are significantly upregulated in collagen-destructive disorders of the cornea.
  •  Lisäksi he havaitsivat, .että ADAM-peptidaasien ektodomaalinen  hilseily kornean epiteelisoluista välitti liukoisten sytokiinireseptorien tuotantoa.
Additionally, we observed that ectodomain shedding by ADAMs in corneal epithelial cells mediated the production of soluble cytokine receptors.
  •  IL-6 Trans-signalointi saattaa aiheuttaa tulehdusvasteen sarveiskalvon stroomassa, mikä viittaa IL-6 transsignaloinnin  merkitsevyyteen  silmän pintatulehduksessa. Täten MMP ja ADAM- entsyymit ovat tärkeitä osatekijöitä sarveiskalvon tautien patofysiologiassa.
 Trans-signaling of IL-6 can induce an inflammatory response in corneal stroma, indicating the significance of IL-6 trans-signaling in ocular surface inflammation. Thus, MMPs and ADAMs play an important role in the pathophysiology of corneal diseases

LISÄYS:
ADAMS peptidaaseista,  matrix metalloproteinaaseista MMP, MT-MMP,  ja niiden inhibiitorista  TIMP,
TIMP inhibiittorista ja ADAMs entsyymien luonnollisista inhibiittoreista  tekee tutkimuksia
 Gillian Murphy et al.



Tämän ryhmän molekyylien yhteispelin ymmärtäminen on tärkeä  rheologisten kaskadien kanssa suhteissa olevana ja miltei arvaamattomana  tekijänä, joka voi  muuttaa odotettuja paranemistuloksia yhtäkkisesti  suuntaan tai toiseen- kudos voi sulaa tai parantua ennalleen. 
18.4. 2014 
Päivitys:
 Huomaan 18.11. että myös Ebolaviruksen GP geeni tarvitsee prosessoitumsiesna ADMA 17 isäntäsoluentsyymiä.